期刊简介

               1995年创刊,中华人民共和国卫生部主管,中华医学会、国际医药卫生导报社主办。本刊是综合性医学学术期刊,主要栏目:科研课题、基础研究、专家述评、临床研究、病例报告、药物与临床、药学研究、临床检验、中医中药、预防医学、护理研究、医学动态等。                

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  • 杂志名称:国际医药卫生导报杂志
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华医学会;国际医药卫生导报社
  • 国际刊号:1007-1245
  • 国内刊号:44-1417/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录:国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 万方收录(中)
国际医药卫生导报杂志2011年第16期

人博卡病毒广州分离株全基因组序列测定及分析

钟家禹;朱冰;施静;邓力;陈翊;谢嘉慧;张莹莹

关键词:人博卡病毒, 基因组, 序列分析, 广州
摘要:目的 探讨广州地区儿童感染的博卡病毒基因组分子结构特点和基因型类型.方法 参考GenBank上的博卡病毒BJ3064株(DQ988933)基因组设计分段扩增引物,进行PCR分段扩增博卡病毒基因组,PCR产物直接送测序公司测序,序列测定,用ClustalW/X和MEGA5.0等软件分析基因组序列.结果 博卡病毒全基因组为5299 bp,提交到GenBank上的序列号为JN128956,将GZ2010-1株全基因组核苷酸序列与GenBank上的博卡病毒HBOV1、HBOV2、HBOV3、HBOV4基因型的全基因组序列进行ClustalW比较,发现与HBOV1基因型同源性高,为98%~99%,而与HBOV2、HBOV3、HBOV4型的同源性分别为76%、81%、75%.将广州分离GZ2010-1株的VP1基因与Genbank上的HBOV1型株进行比较,结果显示与泰国的2株CU49、CU74的同源性为98%,而与HBOV1型其它株:2株标准株(st1、st2)、JPN-193、BJ3064、WLL-1、GD594等株同源性均为99%,F基因的氨基酸序列同源性为99%~100%.结论 广州地区儿童感染的博卡病毒GZ2010-1株全基因组序列为5299 bp,GenBank序列号为JN128956,GZ2010-1株属于博卡病毒HBOV1型.