期刊简介

               1995年创刊,中华人民共和国卫生部主管,中华医学会、国际医药卫生导报社主办。本刊是综合性医学学术期刊,主要栏目:科研课题、基础研究、专家述评、临床研究、病例报告、药物与临床、药学研究、临床检验、中医中药、预防医学、护理研究、医学动态等。                

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  • 杂志名称:国际医药卫生导报杂志
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华医学会;国际医药卫生导报社
  • 国际刊号:1007-1245
  • 国内刊号:44-1417/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录:国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 万方收录(中)
国际医药卫生导报杂志2018年第23期

利用GEO结肠癌芯片数据分析FOXC1及其相关基因的表达与意义

马红梅;刘曙光;许伟珊

关键词:结肠肿瘤, 基因表达, FOXC1, 基因芯片
摘要:目的 探讨叉头框C1(forkhead box C1,FOXC1)在结肠癌的表达水平与临床病理特征及预后的关系,并分析预测与其表达密切相关的基因及其参与的生物过程.方法 利用高通量基因表达(Gene expression omnibus,GEO)数据库中结肠癌基因芯片数据分析FOXC1与临床病理特征及预后的相关性,采用R2平台,筛选出与FOXC1表达显著相关的基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析.结果 FOXC1的表达与肿瘤分化程度有关(χ2=7.919,P=0.019).Kaplan-Meier法分析显示FOXC1的表达与患者的总生存期有相关性(P=0.045).采用R2平台检测出与FOXC1表达显著相关基因共608个(其中正相关387个、负相关221个),对GO及KEGG通路分析后发现FOXC1高表达的肿瘤样本富集到其中564相关基因,主要涉及到血管生成、细胞增生、凋亡、细胞粘附、蛋白磷酸化信号传导、转录因子结合和上皮间质转化等多个肿瘤发生、发展过程.肿瘤信号通路主要涉及Wnt信号通路.结论 FOXC1表达在结肠癌中是一种不良预后因素,可作为判断预后的标志物.FOXC1表达相关的基因参与了多个结肠癌生物过程和信号通路,可为结肠癌分子标志物的深入研究提供参考.